常染色体隐性痉挛性截瘫59型是由基因SPG59的突变引起的。SPG59基因编码一种叫做FA2H的脂肪酸羟化酶，该酶在神经系统中起着重要的作用。突变导致FA2H功能异常，进而引起神经元的退行性变化，最终导致痉挛性截瘫的症状。