女儿的颅骨微碎综合征是遗传自父母的基因。通常情况下，颅骨微碎综合征是由父母中的一方或双方携带了相关基因突变所导致的。因此，女儿患有颅骨微碎综合征可能是因为父母中至少一方携带了相关基因突变。