通常情况下，进行轴突腓骨肌萎缩症2ee型基因查体并不需要空腹。这种基因查体通常是通过口腔内取样或者血液检测进行的，因此不需要空腹。但是，具体的检测要求可能会因实验室或医疗机构的要求而有所不同，建议在进行检测前咨询医生或实验室以获取准确的指导。