是的，基因体检应当包含所有可能与A1型短指畸形相关的突变类型，以便全面评估患者的遗传风险和疾病发展。通过检测所有可能的突变类型，可以更准确地诊断和预测患者的病情发展，为患者提供更好的治疗和管理方案。