常染色体隐性耳聋88型是由GJB2基因突变引起的一种遗传性耳聋。全外显子测序是一种全面检测基因组中所有外显子的方法，可以检测出所有可能存在的突变，包括罕见的突变。因此，对于常染色体隐性耳聋88型的分子诊断来说，全外显子测序是更好的选择，可以更全面地检测出可能存在的突变，提高检测的准确性和可靠性。