是的，有些主动脉弓异常-面部畸形-智力障碍综合症患者并没有检测到明显的基因突变。这可能是因为目前对该症候群的基因突变了解还不够全面，或者是因为患者的基因突变位点在目前的检测范围之外。因此，即使疾病解码结果为阴性，也不能完全排除患有该症候群的可能性，诊断仍需综合临床表现和其他检查结果。