常染色体隐性遗传45型智力发育障碍疾病解码通常不包括线粒体全长测序检测。常染色体隐性遗传45型智力发育障碍是由染色体上的基因突变引起的遗传疾病，与线粒体DNA的突变无直接关系。因此，在进行常染色体隐性遗传45型智力发育障碍疾病解码时，通常不会包括线粒体全长测序检测。如果需要进行线粒体全长测序检测，需要另外进行相关的检测项目。