X连锁综合征智力发育障碍35型是由基因MECP2的突变引起的。MECP2基因编码了甲基化CpG结合蛋白2，是一个重要的转录抑制因子，对神经元的发育和功能起着关键作用。MECP2基因突变会导致Rett综合征，这是一种影响神经系统发育的罕见遗传性疾病。