是的，MLPA检测可以用于检测基因组中的大片段缺失或重复，对于身材矮小、耳道闭锁、下颌发育不全和骨骼异常这种复杂的遗传疾病，MLPA检测可以提供更全面的基因信息，有助于更准确地诊断和治疗。因此，在进行分子诊断时，包括MLPA检测是很有必要的。