通常情况下，做囊型包虫病基因解码并不需要空腹。这种基因解码是通过采集患者的唾液或血液样本进行分析，与饮食无关。因此，患者可以在任何时间进行这种基因解码，无需空腹。如果有特殊要求，医生或实验室会提前告知患者需要空腹进行检测。